企业申请ISO9000认证的认证流程如下：

     根据企业的实际情况建立一套适合企业的质量管理体系；企业在管理层人员中任命管理者代表和几个内审员；企业的质量管理体系要运行至少三个月；企业要进行一次内审和管理评审；企业向有关机构申请认证；认证机构安排现场审核；审核通过，注册并颁发证书。